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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
12/02/2015 |
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Data da última atualização: |
26/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BIEGELMEYER, P.; OLIVEIRA, M. M.; CARDOSO, L. L.; GOMES, C. C. G.; HIGA, R. H.; DIONELLO, N. J. L.; CAETANO, A. R.; STEIBEL, J. P.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliação: |
PATRÍCIA BIEGELMEYER, UFPEL; MAURICIO MORGADO OLIVEIRA; LEANDRO LUNARDINI CARDOSO; CLAUDIA CRISTINA GULIAS GOMES, CPPSUL; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; NELSON JOSÉ LAURINO DIONELLO, UFPEL; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; JUAN P. STEIBEL, MICHIGAN STATE UNIVERSITY; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
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Título: |
Estimation of linkage disequilibrium, persistence of phase and effective population size of Brazilian Hereford and Braford breeds. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A set of 41,241 SNP genotypes from 2,435 Hereford (HH) and Braford (BO) bovines were analyzed to estimate linkage disequilibrium (LD) levels, persistence of phase and effective population size of these populations. LD levels were estimated using the squared correlation of alleles at two loci (r2) at varying distances. Average r2 between adjacent SNP was 0.21 for HH and 0.16 for BO. Average inter-marker distance was 61 kb in both breeds. Useful LD values (r2>0.2) were observed at 0-60 kb bins in HH and 0-20 kb bins in BO. Breeds demonstrated moderate to strong persistence of phase at all distances (range=0.53-0.97). The greatest phase correlations (r>0.9) were found in 0-50 kb bins. LD estimates decreased rapidly with increasing distances between SNPs, however, useful LD was observed in genomic regions spanning up to ~50 kb. |
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Palavras-Chave: |
Desequilíbrio de ligação; Persistence of phase; Tamanho populacional. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Linkage disequilibrium; Population size. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114443/1/estimation-Biegelmeyer.pdf
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Marc: |
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300 $aNão paginado.
520 $aA set of 41,241 SNP genotypes from 2,435 Hereford (HH) and Braford (BO) bovines were analyzed to estimate linkage disequilibrium (LD) levels, persistence of phase and effective population size of these populations. LD levels were estimated using the squared correlation of alleles at two loci (r2) at varying distances. Average r2 between adjacent SNP was 0.21 for HH and 0.16 for BO. Average inter-marker distance was 61 kb in both breeds. Useful LD values (r2>0.2) were observed at 0-60 kb bins in HH and 0-20 kb bins in BO. Breeds demonstrated moderate to strong persistence of phase at all distances (range=0.53-0.97). The greatest phase correlations (r>0.9) were found in 0-50 kb bins. LD estimates decreased rapidly with increasing distances between SNPs, however, useful LD was observed in genomic regions spanning up to ~50 kb.
650 $aBeef cattle
650 $aLinkage disequilibrium
650 $aPopulation size
650 $aGado de corte
653 $aDesequilíbrio de ligação
653 $aPersistence of phase
653 $aTamanho populacional
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700 1 $aGOMES, C. C. G.
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700 1 $aCAETANO, A. R.
700 1 $aSTEIBEL, J. P.
700 1 $aCARDOSO, F. F.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre; Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
17/09/2014 |
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Data da última atualização: |
03/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LUNZ, A. M. P.; OLIVEIRA, M. do S. P. de; ARAÚJO, C. S. de; MESQUITA, J. F. B. de. |
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Afiliação: |
AURENY MARIA PEREIRA LUNZ, CPAF-AC; MARIA DO SOCORRO PADILHA, CPATU; Cleyton Silva de Araújo, Uninorte; Jessika Fyama Batista de Mesquita, Universidade Federal do Acre (Ufac). |
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Título: |
Biometria de plantas de açaizeiro (Euterpe oleraceae Mart.) nas condições edafoclimáticas de Rio Branco, Acre. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 23., 2014, Cuiabá. Fruticultura: oportunidades e desafios para o Brasil: anais. Cuiabá: SBF, 2014. |
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Páginas: |
4 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo do presente trabalho foi avaliar a biometria de plantas de açaizeiros que compõem a área de produção de sementes de açaí da Embrapa Acre. |
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Palavras-Chave: |
Acre; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; BRS Pará; Embrapa Acre; Ensayos de variedades; Factores ambientales; Rio Branco (AC); Western Amazon. |
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Thesagro: |
Açaí; Biometria; Comportamento de Variedade; Condição Ambiental; Euterpe Oleracea. |
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Thesaurus NAL: |
Biometry; Environmental factors; Euterpe; Variety trials. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112114/1/25320.pdf
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Marc: |
LEADER 01348nam a2200373 a 4500
001 2000701
005 2023-11-03
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aLUNZ, A. M. P.
245 $aBiometria de plantas de açaizeiro (Euterpe oleraceae Mart.) nas condições edafoclimáticas de Rio Branco, Acre.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 23., 2014, Cuiabá. Fruticultura: oportunidades e desafios para o Brasil: anais. Cuiabá: SBF$c2014
300 $a4 p.$c1 CD-ROM.
520 $aO objetivo do presente trabalho foi avaliar a biometria de plantas de açaizeiros que compõem a área de produção de sementes de açaí da Embrapa Acre.
650 $aBiometry
650 $aEnvironmental factors
650 $aEuterpe
650 $aVariety trials
650 $aAçaí
650 $aBiometria
650 $aComportamento de Variedade
650 $aCondição Ambiental
650 $aEuterpe Oleracea
653 $aAcre
653 $aAmazonia Occidental
653 $aAmazônia Ocidental
653 $aBRS Pará
653 $aEmbrapa Acre
653 $aEnsayos de variedades
653 $aFactores ambientales
653 $aRio Branco (AC)
653 $aWestern Amazon
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700 1 $aARAÚJO, C. S. de
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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